Биоинформатикийн үндэс

ICSI310 / Бакалавр

Багц цаг: 3

Мэдээлэл, компьютерийн ухааны тэнхим

Улирал харгалзахгүй

Лекц: 2 цаг - 16 хоног

Семинар: -

Лаборатори: 3 цаг - 16 хоног

Бие даалт: -

Зорилго

Биоинформатикийн үндсэн мэдлэг, боломж, хэрэглээ, өргөн хэрэглэгддэг арга техникийг молекул эволюцийн үндэстэй нь холбон заана. Дадлагын хичээл дээр амьдралын бодит жишээн дээр ажиллаж, дадал олгоно. Үр дүнд нь нуклейн хүчил, уургийн дараалал, уургийн 3 хэмжээст бүтцийн өгөгдөлд анализ хийх, хайлт болон харьцуулалт хийх, филогенетикийн анализ хийх, гаргаж авсан үр дүнг тайлбарлах, үр дүнд дүгнэлт хийх, цаашид биоиформатикийн чиглэлээр гүнзгийрүүлэн судлах чадвар эзэмшүүлнэ.

Товч агуулга

:Биологийн мэдээллийн хувьсгал. Биоинформатик бусад шинжлэх ухаантай холбогдох нь. Нуклейн хүчил, амин хүчлийн физик химийн шинж чанарууд. Үндсэн компонентын анализ (Principal Component Analysis)-ыг хэрэглэх нь. Молекул эволюц, популяцийн генетик ба биоинформатик. Удмын мод, коалесенсийн үзэгдэл, хүний гарал үүсэл. Молекулын эволюцийн загварууд. Онооны матрицууд: PAM, BLOSUM, log-odd онооны матрицууд, харьцуулалтын оноо. Ген, уургийн мэдээллийн бааз, өгөгдлийн сангууд. Дарааллын харьцуулалтын алгоритмууд, хос болон олон дарааллын харьцуулалт, локаль ба глобаль харьцуулалт. Өгөгдлийн санд хайлт хийх. Филогенетикийн аргууд.